高新技術(shù)企業(yè)認定主要主管部門：科技、稅務部分、財務，其他相關(guān)部分：環(huán)保、審計、質(zhì)量/安監(jiān)等部分，以下介紹各個部門在高新技術(shù)企業(yè)認定中的主要作用！

財務部分

1. 每年定期對承擔高企審計的事務所進行草稿等危險查看，并抽選部分企業(yè)進行延伸查看
2. 會計師事務所行業(yè)協(xié)會自律查看。

科技部分

1. 專利權(quán)屬及專利時效承認
2. 技術(shù)范疇是否歸于管理辦法或作業(yè)指引中的范疇
3. 申報材料各項指標核對
4. 審報前后各期數(shù)據(jù)對等到與高新年報數(shù)據(jù)對比
5. 主要產(chǎn)品（服務）收入占高新收入比例是否超越50％

環(huán)保部分

1. 是否存在環(huán)評危險
2. 是否存在嚴重環(huán)境違法行為

質(zhì)量/安監(jiān)部分    

是否存在嚴重質(zhì)量、嚴重安全事故
審計部分
1.針對行政公職人員瀆職、納賄等違法行為的延伸查看
2.國有企業(yè)自身的定期審計查看
03.企業(yè)備查材料

1. 知識產(chǎn)權(quán)證書
2. 科技人員證明材料
3. 研制活動證明材料
4. 科技成果轉(zhuǎn)化證明材料
5. 研制費用明細賬及相關(guān)憑據(jù)
6. 產(chǎn)學研協(xié)作證明材料
7. 高新收入證明材料
8. 查看部分要求的其他材料

稅務部分

1. 申報材料與稅務申報數(shù)據(jù)是否有抵觸
2. 研制費用加計扣除存案查看
3. 高企確定稅收優(yōu)惠存案查看
4. 其他相關(guān)稅務查看

高新技術(shù)企業(yè)稅收優(yōu)惠資歷有效期為三年，許多企業(yè)注重申報，忽視資歷維持，從而帶來潛在的稅務危險。根據(jù)《高新技術(shù)企業(yè)確定管理辦法》要求，“科技部、財務部、稅務總局應樹立隨機查看和重點查看機制，加強對各地高新技術(shù)企業(yè)確定管理作業(yè)的監(jiān)督查看。”因此，企業(yè)不僅要注重確守時材料的預備，更應當注重資歷維持，為期滿后從頭確定及后續(xù)可能面臨的查看做好充分預備。